Dada la escasez mundial de reactivos de prueba NAAT para el SARS-CoV-2, se han propuesto pruebas grupales de múltiples etapas de muestras combinadas (a veces llamadas pruebas combinadas o pruebas por lotes) como un medio para conservar reactivos de prueba limitados. Con este método, las alícuotas de múltiples muestras de pacientes (p. Ej., 4-16) se combinan y analizan como una sola muestra.
Si el resultado de la prueba combinada es negativo, no se realizan pruebas adicionales y los resultados de la prueba para cada una de las muestras que se combinaron se informan como negativos.
Sin embargo, si el resultado de la muestra combinada es positivo, cada muestra se analizará de nuevo individualmente para identificar una o más muestras que tengan un resultado positivo.
En el cribado de enfermedades infecciosas, las pruebas combinadas son más efectivas en situaciones en las que la prevalencia de un patógeno en particular es baja, por lo que la repetición de pruebas de muestras individuales, no combinadas, es algo poco común.
Las pruebas combinadas se emplean comúnmente para detectar a los donantes de sangre en busca de una variedad de patógenos transmitidos por transfusiones mediante pruebas de amplificación de ácido nucleico que están aprobadas / autorizadas por la Administración de Drogas y Alimentos de los EE. UU. (FDA) específicamente para pruebas combinadas. Los laboratorios pueden emplear una estrategia de prueba conjunta para el SARS-CoV-2 cuando utilizan una prueba que ha recibido autorización de uso de emergencia para este propósito por parte de la FDA. Hay más orientación disponible en el sitio web de los CDC.
En este momento, hay varios pros y contras de las pruebas combinadas a considerar:
PROS
La combinación puede ayudar a conservar los reactivos de prueba y facilitar las pruebas de vigilancia de grandes poblaciones con baja prevalencia de infección. La agrupación también puede ayudar a aumentar la cantidad de pruebas que se pueden realizar utilizando instrumentación de prueba con un rendimiento limitado.
CONTRAS
Actualmente no existe una infraestructura bien establecida disponible para respaldar la agrupación de muestras para pruebas de diagnóstico en laboratorios clínicos, como la toma de alícuotas automatizada de muestras y el software para gestionar la agrupación y la deconstrucción de agrupaciones positivas para pruebas de muestras individuales. Estos sistemas son esenciales para minimizar los errores humanos y requieren experiencia, soporte del sistema de información de laboratorio y una evaluación exhaustiva antes de la implementación. Sin ellos, los laboratorios deben realizar alícuotas manuales para la combinación de muestras, lo que aumenta el riesgo de mezcla de muestras y contaminación cruzada.
La combinación también conducirá a una reducción en la sensibilidad para detectar el ARN del SARS-CoV-2 en una muestra determinada, porque las muestras se combinan, lo que lleva a una dilución general de la muestra. En general, cuanto mayor sea el conjunto de muestras, mayor será el riesgo de generar un resultado falso negativo al analizar las muestras combinadas. Las implicaciones clínicas de esta posible pérdida de sensibilidad deben tenerse en cuenta para las poblaciones de pacientes que se están evaluando. La FDA exige que los laboratorios que realizan las pruebas realicen sus propios estudios de validación de ensayos específicos de la población (sintomáticos frente a asintomáticos) para poblaciones de pacientes relevantes en las instituciones de prueba, para demostrar una pérdida mínima de sensibilidad analítica desde las pruebas individuales hasta las pruebas de grupo. Para las instituciones que deseen utilizar varios ensayos con muestras agrupadas, cada ensayo deberá validarse individualmente. Este requisito impone una enorme carga de tiempo y dinero a los laboratorios clínicos que ya están sometidos a esfuerzos. Consulte el sitio web de los CDC para obtener más información.
Aunque los reactivos de prueba se conservan durante las pruebas en grupo, los viales de recolección de muestras, hisopos y otros consumibles plásticos utilizados en las pruebas que también enfrentan limitaciones de suministro no necesariamente se conservan. Además, la combinación no proporciona ahorros significativos de tiempo o eficiencia para el personal de laboratorio, porque cada tubo de muestra aún debe ser manipulado por el personal del laboratorio durante la combinación manual. El tiempo de manipulación requerido por muestra puede aumentar en muchos laboratorios debido al mayor trabajo de pipeteo manual requerido durante el proceso de prueba.
La combinación de muestras dentro del laboratorio no abordará los desafíos logísticos asociados con la recolección de muestras, incluidos los tiempos de espera prolongados en los sitios de recolección de muestras.
Finalmente, si bien la agrupación puede reducir el tiempo de respuesta para los resultados negativos, en realidad aumentará el tiempo de respuesta para los resultados positivos, porque es un proceso de prueba de varias etapas para las agrupaciones positivas. Dado que la prevalencia de la infección puede cambiar con el tiempo, la utilidad y la rentabilidad de una estrategia de combinación también pueden cambiar. Si la prevalencia de la infección aumenta, se detectarán más grupos positivos, lo que dará como resultado más pruebas repetidas y tiempos de respuesta más largos para la notificación.
